Este problema comenzó en 1886 cuando la isla fue anexada como colonia francesa. Debido a la anexión muchos de los habitantes originarios de la isla tuvieron que huir a los bosques donde practicaron el cultivo migratorio para sobrevivir. En 1909, en respuesta a el aumento de los cultivos migratorios el Gobernador General prohibió su practica para intentar salvar los bosques que quedaban en el país.
Gracias a esto, se produjeron numerosos levantamientos. Los malgaches no solo ignoraron la prohibición, sino que quemaron ilegalmente muchas hectáreas de bosques como protesta.
La deforestación de Madagascar está poniendo en peligro a las numerosas especies únicas en el mundo que habitan en la isla.
Madagascar vive un período de inestabilidad que ha llevado a que sus bosques hayan sido saqueados por la búsqueda de maderas nobles, lo que a su vez ha traído consigo un incremento en el comercio ilegal de animales salvajes.
A lo largo del siglo XVI, portugueses y franceses (estos últimos de manera “ilegal” según los portugueses) llevaron, en promedio, ocho mil toneladas de madera por año hacia Europa. Además de la extracción de la madera, el comercio de animales y otros productos ocasionaron una importante degradación de la biodiversidad. Más de la mitad de los 8,5 millones de kilómetros cuadrados de Brasil están cubiertos de selva y bosques, la mayor parte en el área amazónica. De esa inmensa cantidad de vegetación, 1,7 millones de kilómetros cuadrados están protegidos por la ley, y el resto está en manos privadas o, en muchos casos, en situación irregular. La deforestación amazónica alcanzó su mayor auge en 2004, cuando 27.000 kilómetros cuadrados de selva fueron devastados. La zona más afectada es el estado de Mato Grosso, centro de las plantaciones de soja de Brasil. 
